Con el objetivo de potenciar la investigación científica en temas de interés para el desarrollo de la sociedad cubana y la provincia agramontina, a mediados de la década de los  90 del siglo XIX, comienzan a desplegar sus acciones diversos centros de estudios pertenecientes a la Universidad de Camagüey “Ignacio Agramonte Loynaz”.
En la actualidad, integrados por los mejores exponentes de la ciencia universitaria del territorio, estos centros amplían sus actividades y muestran resultados positivos a nivel nacional e internacional que se exponen en prestigiosos eventos.
Hoy la UC posee los siguientes centros de estudios:

. Centro de Estudios de las Ciencias de la Educación (CECEDUC)
Centro de Estudios para la Calidad Educacional y Empresarial (CECEE)
Centro de Estudios de Desarrollo y Producción Animal (CEDEPA). Adscrito a la Facultad de Ciencias Agropecuarias.
Centro de Estudios de Desarrollo Empresarial y Territorial (CEDET). Adscrito a la Facultad de Ciencias Económicas y Jurídicas.
Centro de Explotación, Fabricación y Reparación de Equipos y Piezas (CEEFREP). Adscrito a la Facultad de Electromecánica.
Centro de Estudios Multidisciplinarios del Turismo (CEMTUR). Adscrito a la Facultad de Ciencias Económicas y Jurídicas.
Centro de Estudios de Arquitectura e Ingeniería Civil (CENAC). Adscrito a la Facultad de Construcciones.
Centro de Gestión Ambiental (CGA). Adscrito a la Facultad de Ciencias Pedagógicas. Profesoral Superior.